واجهت حكومة مِنْزيس، عند نشوب الحرب العالمية الثانية في سبتمبر من العام نفسه، مهمة صعبة لتنظيم الدفاعات الأسترالية أثناء السنتين اللاحقتين من رئاسته. وتعرض منْزيس وحكومته لانتقاد حاد من أطراف كثيرة لعدم قيامهم بما يكفي لإعداد أستراليا للحرب. وأدى عدم الرضى داخل حزبه في النهاية إلى استقالة مِنْزيس عام 1941م.
قاد مِنْزيس أحزاب المعارضة في الحكومة الفيدرالية من عام 1943م حتى 1949م. قام منزيس بعد ذلك عام 1944م بتوحيد القوى المعارضة لحزب العمال في حزب واحد، سُمي حزب الأحرار الأسترالي. وعاد حزبه إلى السلطة في انتخابات ديسمبر عام 1949م.
وقعت أحداث مهمة كثيرة أثناء رئاسة منْزيس الثانية. ففي عام 1951م، أصبح منْزيس قلقًا من نشاطات الشيوعيين في أستراليا. وقدَّم مشروع قانون لحظر الحزب الشيوعي. لكن جرى تحدي هذا المشروع بنجاح في المحكمة العليا باعتباره غير دستوري. ثم أجرى منْزيس استفتاء عامًا في محاولة لتجديد الدستور، إلا أن هذه المحاولة فشلت أيضًا.
اندلعت الحرب الكورية عام 1950م، وأرسلت أستراليا وحدات عسكرية إلى كوريا لمساندة قوات الأمم المتحدة. كما أرسلت أستراليا عام 1962م مستشارين عسكريين إلى فيتنام. وفي منتصف الستينيات من القرن العشرين، كان لأستراليا 8000 جندي يعملون هناك لمساعدة حكومة فيتنام الجنوبية والولايات المتحدة.