عُين علي مبارك ناظرًا للمكتبات الأهلية، ووكيلًا لديوان الأشغال، ثم شغل عدة مناصب أخرى حتى عام 1877م. عُيِّن ناظرًا للمعارف والأوقاف، فبذل جهودًا كبيرة فيهما. ولما انتهت الثورة العرابية بالاحتلال الإنجليزي عام 1882م عاد اهتمامه بالري وإقامة الجسور وحفر القنوات وتوزيع المياه. ثم رجع مرة أخرى إلى وزارة المعارف وأجرى فيها إصلاحات جمّة، ثم اعتزل الأعمال. وله مؤلفات أخرى منها: الخطط التوفيقية؛ علم الدين، وغيرهما.