بلغت التكاليف التي أنفقتها الولايات المتحدة على إنجاز هذه القناة 380مليون دولار أمريكي تقريبًا، بما فيها 40 مليون دولار، دفعت للشركة الفرنسية، و10 ملايين دولار مقدَّمة إلى حكومة بنما، ومبلغ 20 مليون دولار أنفقت على الأمور الصحية. وبهذا بلغت التكاليف الفعلية لأعمال الإنشاءات بالقناة 310 مليون دولار أمريكي.
القناة منذ عام 1920م. كان سد مادِّين الذي أنجز عام 1935م، العمل التحسيني الأول الذي أجري على القناة. ويقع السد عبر نهر تشاجريز في الجهة الشرقية من القناة، مستحدثًا بحيرة مادين التي تبلغ مساحتها 57كم²، والتي تختزن المياه بغرض استخدامها في بحيرة جاتن. كما أن السد يحتجز مياه فيضانات نهر تشاجريز أثناء فصل الشتاء.
في عام 1936م وافقت الولايات المتحدة على رفع المبلغ، الذي تدفعه لبنما ليصل إلى 430 ألف دولار أمريكي، وذلك تعويضًا لها عن انخفاض قيمة الدولار. وفي عام 1955م رفع المبلغ ليصبح مليوني دولار أمريكي سنويًا تقريبًا.
في الخمسينيات من القرن العشرين. بدأ المهندسون في توسيع معبر جيلارد من 90م، ليصل إلى 150م . وقد تم إنجاز هذا المشروع عام 1970م.
وفي الفترة الممتدة من العشرينيات وحتى السبعينيات من القرن العشرين الميلادي حدث كثير من المنازعات، حول مدى سيطرة الولايات المتحدة على منطقة القناة. لقد عد البنميون القناة جزءًا من بلادهم؛ حيث اعتقدوا أن بنود معاهدة عام 1903م، التي أنشئت القناة بموجبها كانت منحازة بشكل مجحف لصالح الولايات المتحدة، كما لم يخف بعض البنميين استياءهم من العدد الكبير للقواعد العسكرية في المنطقة.