فضلا عن ذلك، تتعاون المفوضية مع الأمم المتحدة والوكالات التابعة لها، والمنظمات الدولية الأخرى ذات الصلة، ومراكز الأبحاث، والمنظمات غير الحكومية، لتسهيل الأداء الفعال لنظام الإنذار المبكر (1)

كما ويعمل النظام القاري للإنذار المبكر، إلى وضع وحدة قياس للإنذار المبكر، تقوم على أساس مؤشرات سياسية واقتصادية واجتماعية وعسكرية وإنسانية، يتم تحديدها وتستخدم التحليل التطورات داخل القارة (2)

ويستخدم رئيس المفوضية المعلومات، لتنفيذ المسؤوليات والمهام الموكلة إليه، وتقديم النصح إلى مجلس السلم والأمن بشان المنازعات المحتملة المهددة للسلم والأمن والاستقرار في أفريقيا (3)

وفي إطار تفعيل النظام القاري للإنذار المبكر، تم عقد اجتماع للخبراء الحكوميين حول الإنذار المبكر ومنع المنازعات في كيمبتون بارك بجنوب أفريقيا في المدة ما بين (17 - 19) كانون الأول/ديسمبر من عام 2006، بهدف التعجيل لتفعيل النظام القاري للإنذار المبكر بحلول عام 2009 (4)

وقد تم عرض النتائج التي تم التوصل إليها في الاجتماع في جنوب أفريقيا، على المجلس التنفيذي للاتحاد الأفريقي في جلسته العاشرة التي عقدت في أديس أبابا في المدة ما بين (2526) كانون الثاني / يناير من عام 2007، وتم إقرار النتائج التي تم التوصل إليها. وطلب من المفوضية اتخاذ جميع الخطوات اللازمة للتعجيل بتفعيل النظام القاري للإنذار المبكر في عام 2009، بما في ذلك تعبئة الموارد المالية والفنية المطلوبة من قبل كل من الدول الأعضاء في الإتحاد الأفريقية (5)