على الرغم من التشابه فيما بين آلية منظمة الوحدة الافريقية والاتحاد الافريقي في مجال تسوية المنازعات، عبر سعي الإتحاد الأفريقي، إلى محاكاة آلية منظمة الوحدة الأفريقية، لا سيما آلية منع وإدارة وتسوية المنازعات، في جوانب عدة، فضلا عن دور كل من مؤتمر رؤساء الدول والحكومات والأمين العام في تسوية المنازعات، عند كل من آلية منظمة الوحدة الأفريقية والإتحاد الأفريقي، إلا أنه بالمقابل، سعى الدول الأعضاء في الإتحاد الأفريقي، نتيجة تزايد حدة المنازعات المسلحة، لا سيما على الصعيد الداخلي، والآثار السلبية الناتجة عنها، إلى العمل لتطوير آلية الإتحاد الأفريقي في مجال تسوية المنازعات، عبر تجاوز ما رافق آلية منظمة الوحدة الأفريقية من إخفاقات إثناء منع وإدارة وتسوية المنازعات، من خلال:
-عد أهداف ومبادئ مجلس السلم والأمن جزءا من أهداف ومبادئ القانون التأسيسي للاتحاد الأفريقي، يضاف لها أهداف ومبادئ مكملة، تتمثل في الاستجابة المبكرة للمنازعات (م 4/ب) ، والترابط بين التنمية الاقتصادية والاجتماعية وامن الشعوب (م 4/ د) . ويناط بمجلس السلم والأمن بعده الآلية الرئيسة لتنفيذ تلك الأهداف والمبادئ.
د مجلس السلم والأمن من ترتيبات الأمن الجماعي والإنذار المبكر، من اجل الاستجابة الفعالة في الوقت المناسب لأوضاع المنازعات في أفريقيا. وهو بذلك يمثل قفزة نوعية في تشخيص المنازعات وتسويتها.
أن مجلس السلم والأمن يمارس مهامه المنصوص عليها وفق المادة (4/ح، ي) من القانون التأسيسي للاتحاد الأفريقي، من خلال القوة الأفريقية الجاهزة، ومعونة النظام القاري للإنذار المبكر ولجنة أركان الحرب. وهو بذلك يمثل طفرة نوعية في عمل مجلس السلم والأمن، من خلال التدخل في أية دولة عضو، لتسوية أي نزاع سواء أكان ذا طابع دولي أم غير دولي.
وعبر ما تقدم، يتبين أن آلية الإتحاد الأفريقي في مجال تسوية المنازعات (مجلس السلم والأمن) ، أصبح له دور مهم وفعال في إدارة ومنع وتسوية المنازعات في أفريقيا، قياسا بالية منظمة الوحدة الأفريقية، لا سيما عبر حق مجلس السلم والأمن في التدخل لتسوية أي نزاع يهدد السلم والأمن والاستقرار في أفريقيا سواء أكان النزاع ذا طابع دولي أم غير دولي.