سولاويسي. وتتألف من أربعة أشباه جزر طويلة، هي أكثر الجزر الإندونيسية وعورة؛ إذ يبلغ متوسط ارتفاع جبالها 3,000م فوق سطح البحر. الكثير من جبالها بركاني، وبعضها نشط. وتغطي معظمها الغابات. وبعض أراضيها الداخلية خصبة. ويعمل سكان السواحل في صيد الأسماك. وأكبر مدنها وميناؤها هي يوجنج باندانج.
جاوه. أكثر الجزر الإندونيسية كثافة بالسكان (810 أشخاص/كم²) ، تنتشر فوقها آلاف القرى الزراعية، وفي الوقت نفسه هي أغنى الجزر الإندونيسية بالصناعة. وتشمل معظم المدن الإندونيسية بما في ذلك جاكرتا العاصمة. وتمتد عبر جاوه باتجاه شرق ـ غرب سلسلة جبلية يبلغ ارتفاع الكثير منها 3,000م فوق سطح البحر.
سومطرة. هي سادسة كبرى الجزر في العالم، تمتد فيها جبال باريسان التي تعلوها سلسلة من القمم البركانية على امتداد الساحل الجنوبي الغربي. ترتفع هذه القمم لتصل إلى 3,660م فوق سطح البحر. وأكبر مدنها مدان.
جزر سوندا الصغرى. تمتد من بالي باتجاه الشرق نحو 1,100كم إلى تيمور. وتضم بالي غالبية السكان وفيها كبرى مدن هذه الجزر وهي مدينة دنباسار. ومعظم المدن ساحلية، وتعتبر مراكز تجارية. وتيمور هي كبرى جزر هذه المجموعة. وتسيطر إندونيسيا على الجزء الغربي من الجزيرة، بينما يمثل الجزء الشرقي منها دولة تيمور الشرقية المستقلة. وتشمل هذه المجموعة من الجزر عدة جبال أعلاها جبل رنجاني على جزيرة لومبوك حيث يصل ارتفاعه إلى 3,726م فوق مستوى سطح البحر.
المولوكاس. تقع هذه الجزر على خط الاستواء ما بين سولاويسي وغينيا الجديدة، كبرى جزر هذه المجموعة هي جزيرة هالماهيرا التي تبلغ مساحتها 17,790كم². ومعظم الجزر الصغيرة في هذه المجموعة غير مأهولة بالسكان. يعيش معظم سكان مولوكاس في المراكز التجارية الساحلية وكبر ى المدن هي ميناء أمبون.