وفي مجال تخصصه الدقيق نشر الأستاذ الدكتور الطوبي - مستقلاًّ أو مشتركًا مع بعض تلاميذه - (بين عامي 1938م و 1989م) نيِّفًا وأربعين بحثًا في أمهات الدوريات العلمية العالمية، تناول معظمُها دراسات تشريحية أو جنينية لهياكل عدد كبير ومتنوع من الأسماك والعظايا والثعابين المصرية، وجماجمها على الأخص، كانت موضع التقدير العالمي بين العارفين، وأشادت بها المراجع العالمية المختصة، وفي المؤتمر العالمي الأول لعلم الزواحف، الذي عقد في مدينة كانتربرى عام 1989م، كُرِّم الأستاذ الطوبي بين العشرة الأوائل في هذا العلم.