وصلى رسول الله صلى الله عليه وسلم أول صلاة جماعة في هذا المسجد إلى بيت المقدس.
وجدد في مسجد قباء وزاد فيه الخليفة عثمان بن عفان رضي الله عنه في خلافته .. كما جدده وزاد فيه عمر بن عبد العزيز في ولايته على المدينة في عهد الوليد ابن عبد الملك الأموي أثناء عمارته للمسجد النبوي سنة 91 - 93هـ وجعل له مأذنة ورحبة وأروقة وبالغ في تنميقه، ونقشه بالفسيفساء وسقفه بالساج. وعمره أبو يعلى الحسيني سنة 435هـ وجدده جمال الدين الأصفهاني وزير بني زنكي من حكام الموصل سنة 555هـ ثم جدد سنة 671هـ وجدد فيه الناصر بن قلاوون سنة 733هـ. وجدد أكثر سقفه الأشرف برسباي سنة 840هـ، وسقطت منارته سنة 877هـ فجددها قايتباي سنة 881هـ مع عمارة المسجد النبوي.
وذكر السيد جعفر هاشم أن السلطان محمود خان العثماني جدده سنة 1240هـ والعمارة الموجودة الآن هي عمارته. (1)
موقع مسجد قباء ومساحته يقع مسجد قباء في قلب قرية قباء بين الحدائق والنخيل في الجهة الجنوبية للمدينة ويبعد عنها نحوًا من ثلاثة كيلومترات وهو مربع الشكل مساحته 1225مترًا وعدد أعمدته ثلاثون عمودًا منها عمودان مزدوجان في صف الأعمدة المشرفة على صحن المسجد ويقع صحن المسجد في الشمال منه.
وقرية قباء غنية بالماء العذب ومزارع النخيل والحمضيات والعنب والفواكه والخضار ومن ماء هذه القرية تمون المدينة بالماء وماؤها أعذب وأحلى مياه المدينة على الإطلاق والهواء في القرية
(1) أقول في الطبعة الثانية أنه جدد وزخرف وفتح له باب ثاني في العهد السعودي.