توجد أربعة أنواع رئيسية للقطن: 1- قطن المناطق المرتفعة الأمريكي 2- القطن المصري 3- قطن السي آيلندز 4- القطن الآسيوي. وهذه الأنواع المختلفة يشبه بعضها بعضًا في كثير من الصفات، لكنها تختلف في بعض الخصائص الأخرى مثل لون الزهرة وصفات الألياف ووقت الإزهار. ولكل من هذه الأنواع الرئيسية أصناف لها خصائص مختلفة. فبعضها ينمو نموا جيدًا في الأرض المروية، وبعضها يبلغ طول تيلته 44ملم، والبعض الآخر يبلغ طول تيلته 13ملم فقط. كما أن بعض الأصناف تمتاز بقوة أليافها عن الأخرى، وبعضها جنيه بالآلة أسهل من جني الأصناف الأخرى.
ويجب على مزارعي القطن في المناطق المعتدلة ـ حيث يزرع معظم القطن ـ أن يزرعوا محاصيلهم كل عام، لكن في المناطق الحارة والمدارية الرطبة فإن القطن يزهر لعدة سنوات. وبعض النباتات تنمو بارتفاع ثلاثة أمتار.
قطن المناطق المرتفعة الأمريكي. يزرع هذا النوع في معظم الدول المنتجة للقطن. وهذا القطن الشديد الاحتمال ينتج محصولًا وفيرًا تحت ظروف نمو متباينة، ويحتل أكثر من 90% من المحصول العالمي للقطن. ويمكن استخدامه في صناعة منسوجات متعددة؛ فيستخدم في تصنيع الأقمشة المتينة مثل الأشرعة والخيام، وكذلك يستخدم في صناعة القمصان الغالية والملابس الرفيعة المستوى.
يمكن لقطن المرتفعات الأمريكي أن يصل طوله إلى ارتفاع يتراوح بين 30 و 213سم، وله زهرة قشدية بيضاء اللون وألياف بيضاء يبلغ طولها 22 إلى 32 ملم.
القطن المصري. طُوّر القطن المصري من الأصول الوراثية التي يرجع أصلها إلى جنوب ووسط أمريكا. ويعتبر القطن المنوفي أكثر الأصناف شيوعًا ويمتاز بخاصية الألياف القوية الممتازة والتي يبلغ طولها حوالي 38ملم. واستطاع المزارعون في الولايات المتحدة الأمريكية وبيرو تطوير أصناف عديدة تسمّى قطن بيما الأمريكي، وقطن بيما الأمريكي أس - 4 صنف يبلغ طول تيلته 35 ملم.