ولقد نص النظام أيضًا على أن برامج الحاسب تتمتع بالحماية، كما جاء في المادة الثالثة (البند العاشر) من النظام، ويترتب على هذه الحماية منع استخدام ... أو توزيع أو تحميل ذاكرة أجهزة الكمبيوتر أو تحميل الشبكات ببرامج غير أصلية أو مخالفة تراخيص الاستخدام المباعة مع البرنامج، ومتى تم ضبط أي منشأة تجارية أو مصانع أو شركات تعتمد على الحاسب الآلي في أعمالها تستخدم برامج غير أصلية في تشغيل الجهاز فإنها ستكون عرضة لتطبيق العقوبات الواردة بالنظام والتي يمكن إيجازها فيما يلي:
1 -يعاقب المعتدي في حالة ضبطه للمرة الأولى بغرامة مالية لا تتجاوز عشرة ألاف ريال، أو بإغلاق المؤسسة أو المطبعة التي شاركت في الاعتداء لمدة لا تتجاوز 15 يومًا، أو بالعقوبتين معًا إلى جانب تعويض صاحب الحق عما لحقه من ضرر.
2 -يعاقب المعتدي في المرة الثانية بزيادة عقوبة الغرامة لتصل إلى مبلغ لا يزيد عن عشرين ألف ريال، أو بإغلاق المؤسسة لمدة لا تتجاوز 90 يومًا، أو بالعقوبتين معًا، إلى جانب تعويض صاحب الحق.