اعتمدت في التحقيق على ثلاث نسخ:

النسخة الأولى: رمزت لها بالحرف (أ) ، وهي نسخة كاملة مصححة ومقابلة، ودقيقة إلى حدّ كبير، جعلتها الأصل في التحقيق. عدد صفحاتها خمسون. وكتب على صفحة العنوان (مصباح الأرواح في أصول الدين) . حصلنا عليها من المكتبة الوطنية بتونس، وقد أرسلها لي عن طريق البريد الإلكتروني الأخ العزيز الأستاذ نزار بن علي، بعد أن عثر عليها هناك، وهي مندرجة ضمن مجموع مخطوط رقم 7956 بالمكتبة الوطنية بتونس، يحتوي على عشر رسائل. خطه مشرقي، ومقاسه 18×13، وأوراقه 255. و"مصباح الأرواح"هو الرسالة الأخيرة فيه، وتقع بين الورقة 228 ظ - و 253، وعدد سطورها 22. أما بقية الرسائل: فالأولى حاشية على رسالة التصوير والتصديق، مجهولة المصنف. والثانية: رسالة في مبحث الاغلاط الحسية من شرح الشريف على المواقف، صنفها يوسف بن حسن الشيرازي (ت 922 هـ) . والثالثة: رسالة في مغلطة الجذر الأصم لمحمد بن أسعد. والرابعة: كتاب تحقيق الكليات للقطب التحتاني. والخامسة: إجازة الدواني لأحد العلماء. والسادسة: رسالة في الفراسة لأرسطالطيس. والسابعة: قصائد في التصوف. والثامنة: قصيدة في الطهارة بالفارسية. والتاسعة: حلية الأبدال لمحيي الدين بن عربي.

النسخة الثانية: رمزت لها بالحرف (ب) ، حصلت عليها من مجموعة تشستربتي المحفوظة في الجامعة الأردنية، وأشكر الموظفين الذين ساعدوني في تصويرها، وهي نسخة دقيقة أيضًا فيه بعض الفوارق مع النسخة الأولى، وقد أثبت الفوارق في الهوامش، ورجحت في بعض المواضع ماورد في هذه النسخة، فأثبته في صلب