تُعدّ مرحلة النوبات التي يحدث فيها الشهيقُ أخْطَر مرحلة للمرض، وتمتد عادة إلى مابين أسبوعين إلى ثلاثة أسابيع. وفي هذه المرحلة تحدث نوباتُ السُّعال، خلال اللَّيل في البداية، وبعدها تحدث خلال الليل والنهار. ويُكثر المريض من تقيُؤِ قطع من المخاط بعد تلك النوبات السعالية. وقد تُؤدّي النوباتُ إلى ضعف دورة الأكسجين التي يمكن أن تؤدي بدورها إلى اختلاجات. أما المشاكل الأخرى فيمكن أن تشمل الالتهاب الرئوي (ذات الرئة) وتهتك الرئتين. وهناك احتمال موت مرضى السعال الديكي خاصة الرُضّع تحت عمر 6 أشهر في مرحلة النوبات.
وفي مرحلة النقاهة يهدأ السّعالُ ويقل تقيّؤُ المخاط. ويبدو التحسّن على المرضى، وفي النهاية يعودون إلى حالتهم الصحية. وقد يستغرق الشفاء التام أسابيع أو شهورًا.
العلاج والوقاية. يستخدم الأطباء المضاد الحيوي إريثرومايسين لعلاج السّعال الديكي، وإذا أُعطي في المرحلة النزلية يمكن لهذا الدواء إيقاف المرض أو التقليل من حدته. وبعد بداية مرحلة النوبات، تبدأ مراكز العلاج في مساعدة المريض على التنفس بشكل طبيعي للحد من تكرار نوبات السّعال الحادة.
وتحصين الأطفال بلقاح السعال الديكي يقيهم ذلك المرض. ولمعرفة جدول مُوصّى به للتطعيم ضد السّعال الديكي، انظر: التحصين. ويصف الأطباء الإويثرومايسين للمساعدة في منع تطور السّعال الديكي للأشخاص غير المحصّنين الذين لديهم استعداد للإصابة بالمرض.