وتتكاثر معظم أنواع الفطريات عن طريق تكوين الأبواغ، ويتم إنتاج بعض الأبواغ باتحاد الأمشاج (الخلايا الجنسية) . أما بعضها الآخر، فيسمى الأبواغ غير الجنسية أو الأبواغ الناقصة وهي تنتج دون اتحاد الأمشاج. وتقوم الكثير من الفطريات بإنتاج الأبواغ إما جنسيًا أو لا جنسيًا. ويتم نثر الكثير من الأبواغ بوساطة الرياح، بينما يتم نقل بعض الأبواغ بوساطة الماء أو الحيوانات. ويقذف عيش الغراب وبعض الفطريات الأخرى الأبواغ بعيدًا. وإذا سقط أحد الأبواغ في موقع مناسب فإنه ينبت (يبدأ النمو) وينتج بعد فترة غزلًا فطريًا جديدًا.
ويمكن أن تتكاثر الخمائر عن طريق تكوين الأبواغ، ولكن معظم أنواعها تتكاثر بوساطة التبرعم. ويظهر انتفاخ في خلية الخميرة عندما تَتَبرعم، ثم ينمو جدار خلوي ليفصل بين البرعم والخلية الأصلية ثم يتطور هذا البرعم ليصبح خليةً جديدة.
عفن الخبز الأسود هذا العفن من الفطريات الأكثر شيوعًا؛ فخلال نحو عشرة أيام يغطي العفن سطح قطعة الخبز (كما هو مبين في الرسم على اليمين) ويمكن مشاهدة الأجسام الثمرية (كما هو مبين في الصورة الوسطى) . ويوضح الرسم (على اليسار) تفاصيل أكثر عن تركيب العفن.
الأنواع الشائعة من الفطريات. تنتج الفطريات الخيشومية مثل عيش الغراب السام وعيش الغراب الصالح للأكل أبواغها ـ وهي أبواغ وحيدة الخلية ـ في خياشيم في منطقة أسفل القلنسوة. انظر: عيش الغراب. ويعيش كثير من أنواع عيش الغراب مثل عيش الغراب المظلي أو عيش غراب الحقول على مخلفات النباتات والحيوانات بالتربة.