رتَب المؤلف كتابَه على ثلاثة عشر بابًا:
1 -في انقسام القلوب إلى صحيح وسقيم وميت.
2 -في ذكر حقيقة مرض القلب.
3 -في انقسام أدوية أمراض القلب إلى طبيعية وشرعية.
4 -في أن حياة القلب وإشراقه مادة كل خير فيه، وموته وظلمته مادة كل شر وفتنة فيه.
5 -في أن حياة القلب وصحته لا تحصل إلّا بأن يكون مدركًا للحق مريدًا له مُؤثِرًا له على غيره.
6 -في أنه لا سعادة للقلب ولا لذة ولا نعيم ولا صلاح إلّا بأن يكون إلهه هو معبوده وأحبَّ إليه من كل ما سواه.
7 -في أن القرآن الكريم متضمن لأدوية القلب وعلاجه من جميع أمراضه.
8 -في زكاة القلب.
9 -فىِ طهارة القلب من أدرانه وأنجاسه.
10 -في علامات مرض القلب وصحته.
11 -في علاج مرض القلب من استيلاء النفس عليه.
12 -في علاج مرض القلب بالشيطان.
13 -في مكايد الشيطان التىِ يكيد بها ابنَ آدم.