ودان ممثل «المجلس الأعلى في سورية ولبنان» بيان جبر اغتيال الخوئي واعتبر في تصريح لـ «الرأي العام» الحادث «غوغائيا يهدف الى زعزعة الأمن والاستقرار في النجف الاشرف والحادث كان بسبب رغبة البعض في طرد ومحاسبة حيدر الرفيعي سادن الروضة في صحن الامام علي عليه السلام وبعد أن خرج لهم السيد عبدالمجيد الخوئي طالبًا منهم أن ينسوا الماضي وانه لا يمكن أن نحاسب كل من تعاون مع النظام السابق كون هناك من كان مجبرًا على ذلك، وان التسامح أمر مطلوب لكن بعضهم رفض ذلك وطلبوا منه عدم التدخل وتهجموا عليه مما جعله يسحب من أحد مرافقيه مسدسًا واطلق النار في الهواء لتفريق المجاميع الذين طعنوه ودخلوا على حيدر الرفيعي وطعنوه أيضًا، وهذا أمر نستنكره وندينه، فالحوار الهادئ الهادف هو الأمر المطلوب الآن والا أصبحنا كصدام ونظامه, ونتوقع أن يسود الهدوء والسكينة في النجف خصوصًا بوجود السيد علي السيستاني والسيد محمد سعيد الحكيم وهما من المراجع المعتمدة لكل الشيعة في العالم» .

الراي العام الكويتية13/4/2003

لخوئي ضرب بالسكاكين ثم ربطوه بعمامته وسحلوه

الخوئي ضرب بالسكاكين ثم ربطوه بعمامته وسحلوه

اسباب القتل

لانه رشح حيدر الكلدار لتولي السدانة لجمع اموال النذور

لانه حاول البروز لتولى مهام ادارة مدينة النجف

الصراع العنصري بين المراجع ذات الاصول الفارسية وتلك العربية لتولي رئاسة أعلى الهرم المرجعي في النجف

وقد قتل مع السيد مجيد الخوئي مرافقه السيد حيدر الكلدار وهو شخصية معروفة رشحه السيد الخوئي لتولي سدانة الروضة الحيدرية بالنجف لضمان استقلاليتها عن الدولة. لكن تفاوتت تقديرات الشيعة لكلدار خصوصا في اتجاه ميوله البعثية.