أما مخطوطة مشكاة، فهى محفوظة بالمكتبة المركزية بجامعة طهران تحت رقم 375ضمن مجموعة مخطوطات السيد محمد مشكاة المهداة إلى المكتبة. وقد رقمت الأوراق الخاصة بالمخطوطة إلى الرقم 167وسقط ترقيم ورقة بعد كل من الأرقام 33، 72، 148، فيكون مجموع أوراق المخطوطة 17ورقة. ومقاس الورقة 5ر 1522سم، وتشغل الكتابة 2ر 518ر 10سم، وعدد سطور صفحتها 21سطرا. وخطها نستعليق واضح. ولم يذكر بها اسم الناسخ أو تاريخ النسخ، ويبدو من الفحص الظاهرى أنها حديثة الكتابة، ونرجح أنها كتبت في القرن الثاني عشر الهجرى، أى القرن الثامن عشر الميلادى. وهى مثل مخطوطة القاهرة في احتوائها على تلخيص الكتب الأربعة الأولى فقط. ويقع تلخيص كتاب المقولات في السبع عشرة ورقة الأولى. وناسخ المخطوطة شأنه شأن الكتاب الإيرانيين لا يميز بين حالتى التذكير والتأنيث في الفعل، وأيضا أهمل نقط بعض الحروف، والمخطوطة بها خرم فى

أوراقها في أكثر من موضعين. ومخطوطة مشكاة تقدم في مواضع ثلاثة من النص قراءة أفضل مما في مخطوطتى فلورنزا وليدن في نفس المواضع المشار إليها في مخطوطة القاهرة. أما المواضع الأخرى وهى فقرة 11/ 1، 38/ 1، 43/ 1فإنا لا نستطيع الجزم بأنها توافق مخطوطة القاهرة نظرا لوجود خرم في مخطوطة مشكاة في هذا الموضع. ولتشابه المخطوطتين فقد عوملت مخطوطة مشكاة معاملة مخطوطة القاهرة من حيث فروق الروايات مع إهمال الأخطاء الكتابية والنقص وعدم إعجام الحروف.

والمخطوطة الثانية هى مخطوطة شوراى ملى وهى محفوظة بمكتبة مجلس شوراى ملى بطهران تحت رقم 5496. وتقع في 225ورقة، وعدد سطور صفحتها 21سطرا، وخطها نستعليق واضح. ولم يذكر بنهاية المخطوطة اسم ناسخها ولكنه كتب «قد فرغ من تسويد هذه النسخة الشريفة في 14شهر رمضان سنة 1072هـ» أى مايو 1661ميلادية. وهى مثل مخطوطتى القاهرة ومشكاة في احتوائهما على تلخيص الكتب الأربعة الأولى. ويقع تلخيص كتاب المقولات في الخمس والعشرين ورقة الأولى. وناسخها يهمل في أغلب الأحيان إعجام حروف الكلمات، ولذلك فقد عوملت مثل مخطوطة مشكاة في فروق الروايات والملاحظات.

أما المخطوطة الثالثة وهى مخطوطة دبلن فهى محفوظة بمكتبة شستربيتي بمدينة دبلن بايرلندا تحت رقم 3769عربى. وعدد أوراقها 275ورقة، ومقاس الورقة 3ر 319ر 10سم، وتشغل الكتابة 2ر 714ر 6سم منها، وعدد سطور صفحتها يتراوح بين 22و 28سطرا في كل صفحة، وذلك لأن

ثلاثة ناسخين قد تناوبوا كتابتها. ويبدو على الكتابة طابع العجلة مما ترتب عليه نقص بعض كلماتها وجملها، يضاف إلى ذلك وفرة الأخطاء الإملائية.