المريء عضو أنبوبي ذو جدران مرنة قابلة للتوسع، ويدخل الطعام في المريء من الفم. وفي الثدييات يقود المريء مباشرة إلى المعدة، بينما في عديد من الطيور يكون المريء مزودًا ببروز كيسي الشكل يعرف بالحوصلة. تستطيع الطيور أن تخزن الطعام في الحوصلة إلى أن يكون له متسع في المعدة، كما تخزن الطيور الطعام في الحوصلة لكي تقدّمه لصغارها.
يمر الطعام من مريء الطائر أوحوصلته إلى المعدة. وفي معظم الطيور تتكون المعدة من جزءين. في الجزء الأول من المعدة تضاف العصارات الهضمية للطعام وفي الجزء الثاني من المعدة الذي يعرف بالقانصة وله حوائط عضلية سميكة يتم طحن الطعام، وتحل هذه العملية محل المضغ. ويسهم العديد من أنواع الطيور كالنعام مثلًا، في عملية الطحن ببلعه الحصى أو أي مواد خشنة أخرى.
يمر الطعام من المعدة إلى الأمعاء الدقيقة حيث تُمْتصُّ المواد الغذائية في الدم بينما تمر الفضلات للأمعاء الغليظة. يمتص جدار الأمعاء كل أو معظم الماء الموجود مع الفضلات تقريبًا. وللطيور فتحة في مؤخرة الجسم تعرف بفتحة المجمع. ويتصل المجمع بالجهاز الهضمي وبالأنابيب التي تحمل الفضلات الضارة من الكليتين وبالجهاز التناسلي، وتطرد الفضلات من جسم الطائر عبر هذه الفتحة.
الجهاز الدوري يوزع الدم إلى جميع أنحاء جسم الطائر، ويتكون من القلب والأوعية الدموية. يخفق قلب طائر كبير مثل النعام بالسرعة نفسها التي يخفق بها قلب الإنسان ـ أي حوالي 70 مرة في الدقيقة. ولكن خفقان قلوب الطيور صغيرة الحجم أسرع بكثير من ذلك حيث يخفق قلب أحد الطيور الطنانة أكثر من 1,000مرة في الدقيقة الواحدة. والأوعية الدموية الرئيسية عند الطيور، كما في الفقاريات الأخرى، هي الشرايين والأوردة. تحمل الشرايين الدم من قلب الطائر إلى أجزاء الجسم الأخرى. ويعود الدم راجعًا للقلب بوساطة الأوردة. وحجم قلب الطائر كبير بالقياس إلى حجم جسمه.