وتُعدُّ عملية صنع الجبن في المصانع صورة مطابقة ومتقدمة جدًا لأساليب التصنيع المتبعة في صنع الجبن في البيوت، حيث إن عمليات التصنيع الأساسية لكل أنواع الجبن هي في الأصل واحدة. وتتضمن هذه العمليات خمس مراحل رئيسية وهي: 1- معالجة الحليب بعمليات متعاقبة، 2- فصل خثارة الحليب، 3- معالجة الخثارة، 4- التعتيق أو الإنضاج 5- التغليف. وهنا تظهر اختلافات طفيفة في عمليات التغليف النهائية عند إنتاج عدة مئات من أنواع الجبن المختلفة.
معالجة الحليب. يقوم صناع الجبن بالكشف على الحليب ثم يقومون بإبعاد أية مواد جامدة فيه، وذلك عن طريق عملية تعرف باسم التنقية. وفي هذه العملية يمر الحليب عبر المبسترة التي يتم فيها القضاء على البكتيريا الضارة. وتقوم المضخات بضخ الحليب المبستر في صهاريج معدنية، أو في الراقودات، التي يمكن أن تستوعب كل منها من 3,600 إلى 15,900كجم من الحليب. ويُستخدم حوالي 4,700كجم من الحليب لصنع 450 كجم من جبن الشيدر.
فصل خثارة الحليب. وهي عملية فصل اللبن الرائب عن الحليب. فبعد أن تتم عملية تنقية الحليب تجري معالجته حتى يكوِّن مادة شبيهة بالخردل تُعْرَف باسم الخثارة. وتحتوي الخثارة على سائل يطلق عليه اسم مصل الحليب الذي يجب أن يُفصل قبل أن تتم عملية تصنيع الجبن. ويقوم صنّاع الجبن بتشكيل الخثارة بتسخين الحليب أولًا إلى درجات تتراوح بين 30° و 36°م، ثم يقومون بعد ذلك بإضافة سائل يطلق عليه اسم بادئ الاستنبات للحليب. ويحتوي هذا السائل على البكتيريا التى تشكل الحموض وتحول الحليب إلى رائبً. ويمكن أيضًا إضافة صَبغَة الخضراوات إلى ذلك، وذلك لإضفاء ألوان معينة على الجبن. وتقوم المحركات الآلية في بداية عملية إرابة الحليب بتحريك مواد الاستنبات البكتيري والصبغة بشكل متوازن خلال الحليب.