-من حيث القدم والجودة في النسخ رقم (1) من محتويات المكتبة: تفسير كتاب (المصابيح الساطعة الأنوار) للعلامة عبد الله بن أحمد الشرفي المتوفى سنة 1062هـ، وتأريخ نسخ الكتاب سنة 1075هـ، بخط نسخي ممتاز جدًا يقارب المطبوع والآيات باللون الأحمر بقلم أحمد بن محمد علي الشرفي يقع في 735 صفحة.
-من حيث جودة الخط رقم (2) مصور الجزء الثاني من التفسير المذكور بخط نسخي ممتاز جدًا بقلم علي بن عبد الله الشرفي في 370 صفحة.
-أيضًا المجلد الثالث المشتمل على الجزء الثاني والثالث من التفسير المذكور، وهو بخط نسخي ممتاز وناسخ مجهول وكذلك رقم (4) من محتويات المكتبة وهو من التفسير المذكور بخط نسخي ممتاز بقلم عبد الله بن يحيى حنش.
-ومن أهم المخطوطات التي نسخت في عصر مؤلفها رقم (7) من محتويات المكتبة وهو السفر الأول من كتاب الدر الشفاف المجرد من كتاب الكشاف في التفسير لعلي بن محمد بن أبي القاسم بن محمد بن جعفر المتوفى نحو سنة 840هـ، وتأريخ النسخ سنة 822هـ بقلم نجل المؤلف عبد الله بن علي، وقد قوبل على أصل بخط المؤلف.
-ومن النسخ التي نسخت في عصر مؤلفها كتاب (المعراج في كشف أسرار المنهاج) في أصول الدين للإمام عز الدين بن الحسن، المتوفى سنة 900هـ، وتأريخ النسخ سنة 887هـ، وهو برقم (13) من محتويات المكتبة.
-ومن الكتب الجيدة الخط كتاب منهاج المتقين في معرفة رب العالمين في أصول الدين لمؤلفه يحيى بن الحسين القرشي الصعدي، المتوفى سنة 870هـ، وهو بخط نسخي ممتاز لناسخ مجهول.
-ومنها كتاب (البحر الزخار الجامع لمذاهب علماء الأمصار) للإمام المهدي أحمد بن يحيى المرتضى، المتوفى سنة 840هـ، وهو بخط نسخي ممتاز وحواشي مذهبة والناسخ مجهول.
-الجزء الثاني من كتاب الجامع الكافي لأبي عبد الله العلوي المتوفى سنة 445هـ، بخط نسخي ممتاز بقلم محمد بن حسين شريف.
-الشموس والأقمار الطالعة من أفق فتح العزيز الغفار لمؤلفه يحيى بن محمد المقرائي المتوفى سنة 990هـ، بخط نسخي قديم ممتاز جدًا لناسخ مجهول.
-كتاب مؤازرة الإخوان وتطهير الجوارح من الأدران في الزهد للقاسم بن محمد اليمني المعروف بالشقيفي، المتوفى سنة 760هـ، بخط نسخي ممتاز جدًا وبالألوان بقلم أحمد بن محمد بن أبي القاسم الكستبان سنة 1089هـ.
-ومن الكتب من حيث الخط كتاب رقم (49) طرفة الراغب في الإعراب عن مقدمة ابن الحاجب للإمام القاسم بن محمد المتوفى سنة 1029هـ، بخط نسخي ممتاز وجميل والناسخ مجهول.
-ومن المؤلفات التي بخط مؤلفها رقم (45،46) من المحتويات وهما مجموعان في الخطب والمواعظ والمؤلف صاحب المكتبة السيد محمد عبد العظيم الهادي.
-ومن المخطوطات من حيث قدم النسخ رقم (48) من المحتويات وهو كتاب شرح المنجد في اللغات لمؤلف مجهول وتأريخ النسخ سنة 876هـ، والناسخ مجهول.
-من أهم المجاميع مجموع يشتمل على مؤلفات للإمام زيد بن علي (عليه السلام) وغيره، نسخ المجموع سنة 1375هـ، بخط نسخي جيد جدًا بقلم أحمد بن محمد القاسمي.
-ومن الكتب التي نسخت في عصر مؤلفها كتاب (المواعظ الشافية شرح الأنوار الهادية) للإمام الهادي الحسن بن يحيى القاسمي، المتوفى سنة 1343هـ، وتأريخ النسخ سنة 1316هـ، بقلم حسين بن محسن أبو علي الجوفي.
-كتاب الرسالة الشافية في مساوئ معاوية للقاسم بن حسين أبو طالب، المتوفى سنة 1380هـ، وتأريخ النسخ سنة 1325هـ، بقلم عبد الصمد بن عبد الرحمن بن أحمد أبو طالب.