(أ) مخطوطات خُطَّت بقلم مؤلفها أو في عصره:

1-كتاب المختار من الأحاديث والآثار مختصر من الصحيح المختار لمؤلفه محمد بن يحيى الحوثي وهي بقلمه.

2-التحف الفاطمية شرح الزلف الإمامية للعلامة مجد الدين المؤيدي بقلم صلاح بن أحسن نورالدين.

3-المجلد الأول والثاني والثالث من كتاب مفتاح السعادة لعلي بن محمد العجري المتوفى سنة 1407 هـ، وحميعها خُطَّت سنة 1371 هـ، بقلم محمد بن الحسن العجري.

4-المقاصد الصالحة في الفتاوى الواضحة للمؤلف السابق وهي بقلمه.

5-مقولات وخطب لصاحب المكتبة العلاَّمة يحيى بن عبد الله راوية المتوفى سنة 1414 هـ، وهي بقلم عدد من النساخ.

6-المجلد الأول والثاني من كتاب صحيح المختار للعلاَّمة محمد بن الحسن العجري خطت سنة 1396 هـ، بقلم المؤلف، وكذلك كتاب الكاشف المفيد عن رجال وأخبار التجريد لنفس المؤلف وهي بقلمه أيضًا.

7-كتاب تحرير الأفكار وكتاب الغارة السريعة، وكتاب فصل الخطاب والجميع من تأليف العلاَّمة بدر الدين بن أمير الدين الحوثي وهي بقلم المؤلف.

8-التحف السنيات في تشجير من بحوث من السادات لعلي بن عبد الله ساري وهي بقلمه سنة 1409هـ.

9-التعليق الوافي في تخريج أحاديث الشافي للحسن بن الحسين بن محمد الحوثي المتوفى سنة 1388هـ، وخُطَّ سنة 1382هـ، بقلم العلاَّمة إسماعيل بن أحمد المختفي.

10-المجلد الأول والثاني من كتاب نجوم الأنظار لعبد الله بن الحسن القاسمي، المتوفى سنة 1375هـ، خُطَّ سنة 1338هـ، بقلم أحمد بن محمد القاسمي.

11-القول المبين في تحقيق زكاة الهاشميين لمحمد بن يحيى الحوثي وهي بقلمه، خطت سنة 1391هـ.

12-الدراري المضيئة الموصلة إلى الفصول اللؤلؤية لصلاح بن أحمد بن المؤيدي، المتوفى سنة 1044هـ، وناسخها مجهول، انتهى من نسخها صباح يوم السبت شهر صفر سنة 1041هـ.

13-لوامع الأنوار في جوامع الآثار للعلامة مجد الدين بن محمد المؤيدي وهي بقلم أحمد بن يحيى بن أحمد عبد الكريم حجر، انتهى من نسخها في 3 رمضان سنة 1392هـ، وكذلك كتاب (الجامعة المهمة لأسانيد كتب الأئمة) للمؤلف السابق، والناسخ مجهول وتأريخ النسخ فرغ منه 24/8/1388هـ، وذلك بعناية المجاز له السيد العلامة عماد الإسلام يحيى بن عبد الله راوية.

14-كتاب شفاء صدور الناس شرح معاني الأساس لعقائد الأكياس للعلامة أحمد بن محمد بن صلاح الشرفي، المتوفى سنة 1055هـ، وهي بقلم المؤلف خُطَّت سنة 1031هـ.