أولًا: من المخطوطات القديمة في النسخ

1- (تفسير غريب القرآن) لمحمد بن عزيز السجستاني، المتوفى سنة 330هـ، وتأريخ النسخ القرن التاسع الهجري.

2- (الثمرات في تفسير آيات الأحكام) الجزء الأول ليوسف بن أحمد الثلائي، المتوفى سنة 832هـ، وتأريخ النسخ سنة 896هـ.

3- (تفسير الإمام القاسم بن إبراهيم، المتوفى سنة 246هـ وأولاده) ، وتأريخ النسخ القرن التاسع الهجري.

4- (البرهان في تفسير القرآن) للإمام أبي الفتح الديلمي، المتوفى سنة 444هـ، وتأريخ النسخ القرن السابع الهجري.

5- (جلاء الأبصار) للحاكم الجُشمي، المتوفى سنة 494هـ، وتأريخ النسخ سنة 655هـ.

6- (مشكاة الأنوار الهادمة لقواعد الباطنية الأشرار) للإمام يحيى بن حمزة، المتوفى سنة 749هـ، وتأريخ النسخ سنة 893هـ، وهو بخط نسخي ممتاز، بقلم علي بن داود الجبي.

7- (المعراج إلى كشف أسرار المنهاج) في أصول الدين للإمام عز الدين بن الحسن، المتوفى سنة 900هـ، وتأريخ النسخ سنة 899هـ، أي في عصر المؤلف، وهو بخط نسخي ممتاز.

8- (التحرير) في الفقه للإمام أبي طالب الهاروني، المتوفى سنة 424هـ، وتأريخ النسخ سنة 598هـ.

9-الجزء الرابع من (الجامع في شرح التحرير) للقاضي زيد بن محمد الكلاري (ق5 هـ) ، والمجلد من أقدم مخطوطات المكتبة حيث يرجع تأريخ نسخه إلى سنة 443هـ.

10- (الغيث المدرار شرح كتاب الأزهار) (الجزء الثاني) للإمام المهدي أحمد بن يحيى المرتضى، المتوفى سنة 840هـ، وتأريخ النسخ 886هـ.

11-الجزء الأول من كتاب (الحدائق الوردية) للشهيد حميد المحلي، المتوفى سنة 652هـ، وتأريخ النسخ سنة 690هـ.

12- (مصباح العلوم في معرفة الحي القيوم) لأحمد بن الحسن الرصاص، المتوفى سنة 621هـ، وكتاب (الترجمان) لمحمد بن أحمد مظفر، المتوفى سنة 926هـ، وكتاب (نخبة الأدب) لأبي القاسم الفزاري، وتأريخ النسخ للجميع سنة 945هـ.