1-الجزء الثاني والثالث والرابع على تجزئة المصنف من كتاب (تكميل الشاف في كشف الكشاف) لمحمد بن يحيى بهران، المتوفى سنة 957هـ، بخط نسخي ممتاز خطَّ سنة 964هـ على نسخة المصنف بقلم نجل المصنف عبد العزيز بن محمد بن يحيى بهران، وكذلك الجزء الثالث من ذلك الكتاب خطَّ سنة 945هـ، أي في عصر المؤلف بنفس الخط والناسخ.

2- (البحر الزخار) في الفقه بكل أجزائه للإمام المهدي أحمد بن يحيى المرتضى، المتوفى سنة 840هـ، وهو بخط نسخي ممتاز خط سنة 966هـ، بقلم إبراهيم بن محمد بن إبراهيم بن علي الجملولي.

3- (مقدمة البحر الزخار) لنفس المؤلف بخط نسخي ممتاز خط سنة 984هـ، وكذلك المجلد الأول من (البحر الزخار) خط سنة 966هـ، وكذلك المجلد الثاني من الكتاب نفسه خط في نفس السنة، وكذلك الجزء الرابع من نفس الكتاب خط سنة 967هـ.

4-كتاب مجهول العنوان وهو في اللغة العربية، والمؤلف مجهول وهو من مخطوطات القرن العاشر الهجري.

5- (موصل الطلاب إلى قواعد الإعراب) في النحو لخالد بن عبد الله الأزهري، المتوفى سنة 905هـ، وتأريخ النسخ سنة 993هـ.

6- (المطول) في علم المعاني والبيان والبديع لمسعود بن عمر التفتازاني، المتوفى سنة 791هـ، وهو بخط نسخي ممتاز خطَّ سنة 920هـ.

7- (شرح المختصر) لابن حجر الهيثمي، المتوفى سنة 973هـ، وتأريخ النسخ سنة 998هـ.

تخميس قصيدة القصص الحق للحسين بن أحمد النزيلي، وتأريخ النسخ سنة 947هـ.

ب- مخطوطات خطَّت بقلم المؤلف أو في عصره

1- (قلائد المرجان في الناسخ والمنسوخ من القرآن) لمرعي بن يوسف الحنبلي المقدسي، المتوفى سنة 1033هـ، وتأريخ النسخ سنة 1022هـ، وهي السنة التي انتهى فيها المؤلف من تأليف الكتاب، وقد عرضت عليه وصححها، والناسخ من تلاميذ المؤلف.

2- (الأنهار في فقه الأئمة الأطهار) لعبد الرحمن بن عبد السلام بن أحمد، المتوفى سنة 840هـ، وتأريخ النسخ سنة 833هـ، بخط نسخي ممتاز بقلم علي بن عبد السلام بن أحمد بن علي بن عبد الباعث.

3-الجزء الثاني من كتاب (تفتيح القلوب والأبصار) في الفقه لمحمد بن يحيى بهران، المتوفى سنة 957هـ، وتأريخ النسخ سنة 953هـ ، بخط نسخي ممتاز والناسخ مجهول.

4-الجزء الأول من كتاب (مشارق الأنوار في فوز أهل الاعتبار) لحسن العدوي الحمزاوي المالكي، المتوفى سنة 1303هـ، وتأريخ النسخ سنة 1277هـ.

5- (التوضيح شرح التنقيح) لمحمد بن إسماعيل الأمير، المتوفى سنة 1182هـ، وتأريخ النسخ سنة 1هـ.

6- (العقد الثمين في مدائح المولى شرف الدين) وكذلك كتاب (إشراق النبراس على مدائح المولى العباس) ، وهما من تأليف إسماعيل بن حسين الأجوزي، وهما بخطه.

7- (الحواشي المختصرة من الشرح الوافي لبيان تحفة الطلاب في نظم قواعد الإعراب) لأحمد بن محمد بن عماد بن علي الهايم وهي بقلم المؤلف.

8- (تسهيل مرقاة الوصول إلى علم الأصول) لمحمد بن الحسن بن القاسم، المتوفى سنة 1079هـ، وتأريخ النسخ سنة 1068هـ، بقلم أحمد بن محمد بن المهلا وعلى الكتاب قراءة على المؤلف.

جـ- من محتويات المكتبة صحيح النسائي (السنن الكبرى) في مجلد كبير كامل بأجزائه، وطبع سنة 1214هـ، على نسخة بخط مير نا صر علي.

د- من المخطوطات الجيدة الخط ما يلي:

1-مصحف للقرآن الكريم بخط نسخي ممتاز جدًا، والمصحف نادر ومكتوب باللاز وخطَّ سنة 935هـ، والناسخ مجهول، وعُمِل برسم السلطان الناصر شهاب الدين أحمد بن عبد الملك.

2-الأجزاء الأول والثاني والثالث والرابع من كتاب (تيسير المنان في تفسير القرآن) لأحمد بن عبد القادر بن أحمد شرف الدين، المتوفى سنة 1223هـ، وهي بخط نسخي ممتاز خط سنة 1334هـ، بقلم علي بن أحمد بن محمد بن حسين بن عبد القادر.

3- (شفاء الأوام في أحاديث الأحكام) للأمير الحسين بن بدر الدين، المتوفى سنة 662هـ، بخط نسخي ممتاز جدًا، خطَّ سنة 1067هـ، والناسخ مجهول.

4- (شرح الفصول اللؤلؤية) في أصول الفقه للطف الله بن محمد الغياث، المتوفى سنة 1035هـ، وهي بخط نسخي ممتاز جدًا، خط سنة 1091هـ، بقلم أحمد بن محمد الكستبان.

5- (البحر الزخار بأجزائه كلها) للإمام المهدي أحمد بن يحيى المرتضى، المتوفى سنة 840هـ، خطَّ سنة 1070هـ، بخط نسخي ممتاز جدًا بقلم علي بن صلاح اليحيوي.

6- (معيار أغوار الأفهام في الكشف عن مناسبات الأحكام) لعبد الله بن محمد النجري، المتوفى سنة 877هـ، وهو بخط نسخي ممتاز، خطَّ سنة 1062هـ، بقلم أحمد بن محمد بن عبد الله المهلا.

7- (المصابيح) في السيرة لأبي العباس الحسني، المتوفى سنة 353هـ، وهو بخط نسخي ممتاز جدًا، قريب من المطبعة، خط سنة 1313هـ بقلم أحمد بن ناصر السماوي.

8- (ديوان المتنبي أحمد بن الحسين) ، المتوفى سنة 354هـ، وهو بخط نسخي ممتاز جدًا بقلم علي بن إسماعيل في سنة 1144هـ.