في العقد الرابع من القرن الثالث عشر تقريبًا، ونشأ بين أبويه الطاهرين القاسم بن محمد الحوثي أفضل أهل زمانه وأزهدهم، حليف لقرآن ومن ضرب بكرمه الأمثال، فقد كان ينفق في السنين المجدبة الشديدة فيقال له: أنت ذو تكاليف واسعة وعوائل، فقال: لو بلغت كل برة بدرة لأوجد الله لكل برة درة. وكان (رضي الله عنه) لا يتناول المصحف الشريف من قعود، فإن ناوله أحد قام له إجلالًا وتعظيمًا. وكان يقطع أكثر لياليه وأيامه في مدارسة القرآن الكريم هو وزوجته العالمة الشريفة الفاضلة زينب بنت إسماعيل بن الحسن بن يحيى الشامي الحسني (رضوان الله ورحمته عليهم أجمعين) .
شب الإمام في هذا الجو العامر بالإيمان والعلم والكرامة، ونشأ نشأة كريمة تظهر منه مخايل النبل والأخلاق الفاضلة.