أما عن المكتبات الخاصة فالمعلومات عنها وعن محتوياتها قليلة؛ إذلا مسح شامل من قبل أي جهة رسمية ولا فهارس دقيقة لمعظمها من قبل أصحابها أنفسهم.
وقد أشير بعض الإشارات إلى محتويات بعض المكتبات الخاصة في عدد من المراجع التي كتبت عن مصادر التراث، سنذكرها لا حقًا.
كما صدر للأستاذ عبد الله الحبشي كتاب بعنوان (فهرس مخطوطات بعض المكتبات الخاصة في اليمن) سنة1994م اشتمل على فهارس بعض المكتبات وهي:
-مكتبة السيد عبد الله بن إسماعيل غمضان بصنعاء (48) عنوانًا.
-مكتبة آل الوزير بالسر (77) عنوانًا.
-مكتبة السيد علي بن إبراهيم بصنعاء (176) عنوانًا.
-مكتبة أحمد بن حسن العطاس بحريضة - حضرموت (169) عنوانًا.
-مكتبة المؤرخ محمد بن محمد زبارة بصنعاء (111) عنوانًا.
-مكتبة السيد عبد الله بن محمد بن حسين غمضان بصنعاء (149) عنوانًا.
-مكتبة السيد محمد بن يحيى الذاري بالروضة (118) عنوانًا.
-مكتبة السيد محمد بن محمد بن إسماعيل المنصور بصنعاء (111) عنوانًا.
فيكون مجموع ما فهرسه الأستاذ الحبشي (959) عنوانًا لكتب موزعة على مخطوطات مقاربة لهذا العدد.
ومن الأعمال المشكورة التي بذلت في هذه الصدد بعض التقارير تحت عنوان: (تسجيل المكتبات الخاصة للمخطوطات اليمنية) ، قام بإعدادها الأستاذ عبد الوهاب المؤيد، لحساب دار الفرقان بلندن.
وهي عبارة عن تعريفات موجزة لبعض المكتبات الخاصة في بعض مناطق اليمن شملت: أسماء المكتبات، وعناوينها، وتأريخ تأسيسها إن أمكن، وطريقة تكوينها، وطرق الاستفادة منها إن وجدت، والعدد الإجمالي لمخطوطاتها، وموضوعات المخطوطات وزمنها، ثم بعض نماذج من المخطوطات التي تحتويها المكتبة وحالة المخطوطات، ومن هذه المكتبات نذكر مالم تدخل في كتابنا هذا، وهي:
1-مكتبة بن حورية (المؤيدي) وتعرف باسم مكتبة آل حورية، نسبة إلى لقب مالكها ومكونها الأول السيد: العلامة محمد بن إبراهيم المؤيدي المتوفى سنة1961م، وتوجد في مدينة ضحيان من محافظة صعدة وقد قدر عدد مخطوطاتها بحوالي 150 مخطوطًا (الرقم الإجمالي لكل مكتبة من المكتبات التي ذكرها تقريببي) .
2-مكتبة العلامة: يحيى بن سهيل، المتوفى في منتصف الثمانينات، وهي بنظر ولده القاضي حسن بن يحيى سهيل بمدينة صعدة -حارة شيبان، حوالي 70 مجلدًا.
3-مكتبة يحيى بن عبد الله الضحياني بمدينة صعدة مؤسسها والده السيد عبد الله بن عبد الله الضحياني وزاد فيها الابن. وهي قرابة 50 مجلدًا في وضع جيد.
4-مكتبة العنثري في قرية الطلح، إحدى ضواحي مدينة صعدة، مؤسسها السيد العلامة: عبد الله العنثري، 100 مجلد مخطوط بحوزة أحد الورثة.
5-مكتبة آل الغالبي بضحيان صعدة، وهم أسرة علم شهيرة 150 مجلدًا بحوزة القاضي: عبد الله علي الغالبي.
6-مكتبة السيد: محمد بن يحيى الذاري، وقد تضمنها فهرس الأستاذ: عبد الله محمد الحبشي لبعض المكتبات الخاصة 80 مجلدًا مخطوطًا (الروضة- صنعاء) .
7-مكتبة القاضي: زيد بن علي الأكوع، بمدينة ذمار حوالي30 إلى 40 مجلدًا مخطوطًا، التي بحوزة المذكور، وبقيتها بحوزة بقية ورثة مؤسسها والده العلامة: علي بن محمد الأكوع.
8-مكتبة القاضي: يحيى بن أحمد التعزي، بمدينة ذمار، 40 مجلدًا.
9-مكتبة السيد العلامة: علي بن قاسم بن أحمد الشامي، بمدينة صنعاء،20مجلدًا مخطوطًا.
10-مكتبة آل العنسي القاضي: محمد بن يحيى بن محسن بن سعيد بن حسن بن سعيد، بمدينة ذمار، 30 مجلدًا مخطوطًا.
11-مكتبة آل اليوسفي، الأخوان: حمود وحسن، ابنا محمد بن عبد الله اليوسفي، وهم من أسر العلم المعروفة بذمار، وينسبون إلى القاسم بن محمد، وهي بمدينة ذمار سوق الربوع، 30 مجلدًا مخطوطًا.
12-مكتبة السيد: أحمد بن قاسم الدولة، وولده حسن، بمدينة صنعاء، انتقلت من ذمار، 20 مجلدًا.
13-مكتبة السيد: حمود بن محمد بن أحمد الدولة، بمدينة ذمار، 50 مجلدًا.
14-مكتبة القاضي: أحمد بن عبد الله العنسي، بمدينة ذمار سوق الربوع 32 مجلدًا مخطوطًا.
15-مكتبة المدرسة العلمية بذمار، مدينة ذمار حي المدرسة، 50 مجلدًا في حالة سيئة.
16-مكتبة: أحمد بن أحمد النصافي مدينة ذمار الحوطة 30 مجلدًا مخطوطًا.
17-مكتبة السيد: علي بن حسن الحبسي، صنعاء - الجراف، أصله من ذمار، 31 مجلدًا مخطوطًا.