2 -فرع البحوث العلمية والفتاوى الشرعية:
مهمته: البحث في المسائل الشرعية المستجدة والفصل فيها، باستثناء المسائل التي تصدر باسم الجماعة فإن الأمير يتدارسها مع جميع أفراد اللجنة الشرعية.
توطئة: تعتبر اللّجنة القضائية من الركائز الأساسية لقيام الجماعة. قال تعالى: {لقد أرسلنا رسلنا بالبينات و أنزلنا معهم الكتاب و الميزان ليقوم النّاس بالقسط و أنزلنا الحديد فيه بأس شديد و منافع للنّاس و ليعلم الله من ينصره و رسله بالغيب إنّ الله قوي عزيز} [الحديد:25] .
قال شيخ الإسلام:"و لن يقوم الدّين إلاّ بالكتاب و الميزان و الحديد الكتاب يهدي به و الحديد ينصره".
1 -يتم تعيينه من طرف أمير الجماعة، و لا يتم عزله إلا بالرجوع إلى مجلس الشورى.
2 -يكون القاضي مستقلًا في مباشرة مهامه.
3 -إذا رفعت إليه مظلمة ضد أمير الجماعة فله مراجعتها مع مجلس الشورى لرد المظلمة لصاحبها، و إذا لم يمكن ذلك إلا بإحضاره للقضاء أحضر من طرف مجلس الشورى والقاضي.
4 -يستدعي القاضي المتخاصمين بالاستعانة بأمير الجماعة.
5 -له حق عزل قضاة المناطق، أمّا تعيينهم فيتم من طرف الأمير وأمراء اللجان أي المجلس الشوري.
6 -أحكامه نافذة.
(وعند عدم وجود هذه اللجنة أو الرئيس المؤهل فيقوم بهذه المهام أمير الجماعة ما دام أهلًا لها) .
التّعريف بها: تعتبر اللّجنة العسكريّة من الرّكائز الأساسيّة و الدّعائم القويّة للجماعة، فهي الحصن الحصين و السّياج الواقي لها من الضّربات و الفتن الّتي قد تعصف بها، كما تعتبر وسيلة قمع أصحاب الفتن و الأهواء، و إرهاب للأعداء و هي الّتي تزيح الحواجز من طريق الدّعاة إلى الله، فهي الصّخرة الصّمّاء التي تنكسر عندها أطماع الأعداء، و لذلك ينبغي للجماعة أن توليها اهتمامًا كبيرًا للمحافظة عليها و تزويد أفرادها بجميع أنواع العتاد الحربي العصري، كلّ ذلك في حدود قدرة الجماعة و إمكانياتها.
تكوينها: تتكوّن اللّجنة العسكريّة من قائدها العام و نوّابه الّذين يرأسون ما يتفرّع عن هذه اللّجنة من فروع و هي كالآتي:
1 -فرع التّدريب و التجنيد.
2 -فرع التّموين و التّمويل.