49 - «المسائل الطوسية» ، لم يتم. ذكره أبو جعفر الطوسى، وابن شهرآشوب.
50 - «المسائل المحمديات» ، ذكره النجاشى.
51 - «مسائل مفردات من أصول الفقه» ذكره أبو جعفر الطوسى، وابن شهرآشوب.
52 - «مسائل مفردات» ، نحو مائة مسألة في فنون شتى، ذكره أبو جعفر الطوسى، وابن شهرآشوب.
53 - «المسائل الموصلية الثلاثة» ، ذكره أبو جعفر الطوسى، والنجاشى، وابن شهرآشوب.
وذكر بروكلمان أن منها نسخة مخطوطة في مكتبة مشهد (ضمن مجموعة) .
54 - «مسائل ميافارقين» ، ذكره ابن شهرآشوب، وذكر بروكلمان أن منه نسخة مخطوطة في النجف، في مكتبة خاصة، وأخرى في مكتبة مشهد (ضمن مجموعة) .
55 - «المسائل الناصرية في الفقه» ، ذكره أبو جعفر الطوسى، وابن شهرآشوب.
وقد طبع هذا الكتاب مع كتاب» الجوامع الفقهية» لمحمد بن باقر في طهران 1276.
56 - «مسألة في الإرادة» ، ذكره النجاشى.
57 - «مسألة في دليل الخطاب» ، ذكره النجاشى.
58 - «مسألة في التأكيد» ، ذكره النجاشى.
59 - «مسألة في التوبة» ، ذكره النجاشى.
60 - «مسألة في قتل السلطان» ذكره النجاشى.
61 - «مسألة في كونه تعالى عالما» ، ذكره النجاشى.
62 - «مسألة في المتعة» ، ذكره النجاشى.
63 - «المصباح في أصول الفقه» ، لم يتمه ذكره أبو جعفر الطوسى والنجاشى، وابن شهرآشوب.