وشكل منها إدارة داخلية مستشية منها (رجال هارئيل) خاصة في الفترة التي أصدر فيها اشكول قرارا بتثبيته كمدير للموساد ..

كما جلب معه من الاستخبارات العسكرية إلى الموسادر الوحدة 131) والتي تقوم بتنفيذ العمليات الخاصة). وقد لاحظ عميت داخل الموساد الغياب التام لأي تسلسل حقيقي للقيادة الا بشكل سطحي. وبغياب (هارئيل) اصبحت الموساد"تدور كالدجاجة بدون رأس".

ولكن (عميت) تربي على غير ذلك، تربي على مبدأ"أذا تغير ضابط القيادة فإنه يعرف مسبقا بأن نائبه سيحل محله .. إلى آخر سلسلة القيادة بدون أي اضطراب في الوحدة - ولو للحظة واحدة"، أما في عهد (هارئيل) فلقد كان"هارئيل هو الموساد .. والموساد هو هارئيل". وقد أضفى ميير عميت الصفة الرسمية البيروقراطية على الموساد، واصبح التخصص ظاهرة مميزة في الجهاز.

وفي عهد عميت اعتقل اهم عميلين سريين اسرائيليين في دمشق والقاهرة، بالإضافة إلى فضيحة اختطاف المهدي بن بركة في فرنسا بمشاركة الموساد، واغتياله ... ولقد أعتقل ايلي كوهين في دمشق في 1990

21 واعدم في 1990/ 0 / 19. كما أعتقل (لوتز) في القاهرة في 1995