وأسلحتها غير جاهزة، فقد بدأت بنقل الأسلحة والعتاد من أسفل السفينة إلى السطح، بينما طلب من الحاملة «ساراتوغاء التي كانت جاهزة للتدخل لحماية السفينة «ليبرتيا أن تتريث (بانتظار وصول موافقة البيت الأبيض كما هو واضح) . في تلك الأثناء وخلال غياب نوة الدفاع الجوي للأسطول السادس الأميركي، وصلت ثلاثة زوارق طوربيد إسرائيلية إلى موقع السفينة لإنهاء المهمة كما خطط لها. وكانت السفينة - الهدف) تلتهب وتشتعل بها النيران بعد 20 - 30 دقيقة من بدء الهجوم عليها. نقد تحطمت الهوائيات فيها من جراء قصفها بالقذائف وقنابل النابالم من قبل 12 طائرة إسرائيلية تقريبا

اقتربت الزوارق من الهدف وكانت تسير بسرعة عالية وأطلقت طوربيدات من مسافة 2000 باردة إلا أنه بسبب تواجد زورقين على مسافة قريبة جدأ أحدهما من الأخر، وخوفا من حدوث صدام بينهما لحظة إطلاق القذائف، اخطات قذيفة الزورق الأول هدفها ومر الطوربيد بسلام على بعد 20 قدما من السفينة. أما قذيفة الزورق الثاني فقد مرت بالقرب من مقدمة السفينة واختفت محدثة هديرة يشبه صوت الزورق الطائر، سمعه بوضوح الضابط بريك ايميني، الذي كان يقف مندهشا في المقدمة. أما قذيفة الزورق الثالث، فقد أصابت السفينة إصابة مباشرة وتسببت في مقتل 20 رجل على الفور وحصار (50) رجل على الأقل في كبائنهم التي ارتفع فيها الماء الساعة 10, 10:

بعد حدوث المعجزة بمحافظة السفينة (ليبرتي) على نفسها عائمة، برغم وجود فتحة بقياس 40 قدم على جانبيها قام الرجال الموجودون على ظهور قوارب الطوربيد الإسرائيلية بإطلاق النار لمدة 40 دقيقة من الرشاشات الآلية، على الرجال الذين كانوا يقومون بمكافحة النيران على ظهر السفينة، وعلى الرجال الذين كانوا يقدمون الإسعافات للمصابين، بينما كانوا هم يراقبون السفينة وهي تغرق رويدا رويدا.

وأخيرة وفي الساعة 10, 10 صدر أمر من غرفة قيادة السفينة بالاستعداد لإخلائها تقذف البحارة ثلاثة قوارب مطاطية، بعد أن ربطوها بجسم السفينة وقد قام رجال زوارق الطوربيد الإسرائيلية بإطلاق النار على القوارب واعطبوا أحدها، قبل أن ينسحبوا إلى قاعدتهم في أشدود،،