بتوقيع أمر سري يقضي بتقديم المساعدة إلى"المجاهدين الأفغان الذين كانوا يقاومون النفوذ السوفياتي الشيوعي في بلادهم."

وكان هذا الأمر السري هو في الواقع بداية المتاعب بالنسبة لنظام طاراقي _ أمين وبالنسبة للسوفيات في أفغانستان. ففي 23 حزيران 1979 تمرد الجيش في العاصمة كابول، قرب البازار. وفي 6 آب تمردت وحدة من الجيش الأفغاني، تحت إشراف أو أقله بتشجيع من الى"سي. آي. إي"وعملاء باكستانيين، وحاولت السيطرة على قلعة"بالاهيزار"داخل کابول، وهي في موقع استراتيجي يمكن منه إستهداف معظم أحياء العاصمة. واشتبه السوفيات ب"حفيظ الله أمين"معتبرين أنه كان وراء هذه التمردات العسكرية أو أنه على الأقل كان على علم بأنها سوف تحدث. واعتبروا أنه، نظرا لحسن علاقاته مع السفارة الأميركية في

كابول، يريد في الواقع السيطرة شخصية على الحكم وتحويل"الثورة الأفغانية"إلى دكتاتورية فردية، وذلك ربما بمؤازرة من واشنطن.

وفي 17 أيلول 1979، حصلت معارك بين فصائل الحكم في كابول، وقتل الرئيس"نور محمد طاراقي" (الذي كان مقربا ن موسكو) وحل محله"حفيظ الله أمين".