حدث الحريق هذه المرة بفعل صاعقة أصابت المسجد، وذلك في ليلة الثالث عشر من شهر رمضان من ذلك العام، ويبدو أن المنطقة بعامة كانت تشهد تقلبات في المناخ، فيها رياح وأمطار وصواعق، فيذكر ابن إياس أن مصر شهدت في هذه الفترة نفسها تقلبات جوية غير مألوفة، ثارت رياح من جهة الغرب وكانت عاصفة جدًا وأظلم بسببها الجو وأرعد وأبرق ثم أمطرت السماء مطرًا غزيرًا، وجاء الخبر من دمياط أن الريح قلعت عدة أشجار وهدمت بعض الأماكن وأغرقت بعض المراكب وكانت مهولة جدًا (1) .

(1) بدائع الزهور 3/ 187.