اعتمدنا في نشر هذا القسم من كتاب «الشفاء» على المخطوطات التالية:

1 -مخطوط مكتبة بودلى، پوكوك رقم 119. والمخطوط ردئ، فيه نقص كثير، قليل العناية. وفى خاتمته ورد: «هذا آخر المنطق من كتاب «الشفاء» . ووافق الفراغ منه في العشر الأوسط من ربيع الآخر سنة ثلاث وستمائة».

2 -مخطوط مكتبة بودلى، هنت رقم 111. ويقع قسم «الشعر» في ورقة 126ب حتى نهايته. وهو بخط مغربى. وليس به تاريخ نسخه، لكن يلوح أنه قديم.

3 -مخطوط الديوان الهندى، المخطوط رقم 1420وكان سابقا باسم رتشرد جونسون. خطه مشرقى، واضح، حديث جدا. وقد ورد في آخره أنه نسخ «فى رابع ربيع الأول سنة ثمان وأربعين من المائة الثانية بعد الألف من الهجرة النبوية» ، وهو يناظر سنة 1735م وقد نسخ عن نسخة ترجع الى سنة 891هـ. وعليه تصحيحات في الهامش أو فوق الكلمات وتحتها.

4 -مخطوط المتحف البريطانى رقم 113شرقى. بخط نسخى.

5 -مخطوط من وقف السلطان احمد خان بن غازى سلطان محمد خان (تولى الخلافة في 17رجب سنة 1012وتوفى في 22ذى القعدة سنة 1026) . يقع قسم الشعر فيه من ورقة 1314الى 210ب. وهو بخط نسخى منقوط، مسطرته 31سطرا. وفى خاتمته: «تمت الجملة الأولى من كتاب «الشفا» المشتملة على تلخيص المنطق. واتفق الفراغ منها في أواخر شعبان من سنة ثمان وعشرين وستمائة. وأسأل الله الهداية والتوفيق وسعادة الأبد، فهو الهادى والموفق للصواب».