القضية الأولى: موضوعات القرآن والفترة الزمنية.
القضية الثانية: الثواب والعقاب.
القضية الثالثة: الوحدانية.
القضية الرابعة: الغرانيق.
القضية الخامسة: الصلاة في العهدين المكي والمدني.
القضية السادسة: موضوعات السور المتأخرة.
القضية السابعة: وظيفة الأنبياء.
القضية الثامنة: المقارنة بين الرسول محمد صلّى الله عليه وسلّم وبين ماني.
القضية التاسعة: أسلوب القرآن.
القضية العاشرة: تعدد النزول.
القضية الحادية عشرة: نهاية العالم.
القضية الثانية عشرة: هدف القصص القرآني.
تذكر الموسوعة أنه: «يصعب جدا تصنيف محتويات القرآن، حيث إنه إذا صنفت محتوياته حسب الفترة الزمنية فإن هذا يؤدي إلى تناقض، حيث إن الموضوع المعالج لبعض المواد يختلف باختلاف الفترة الزمنية» .
ونود في هذه القضية أن نتحدث:
أولا: عن موضوعات القرآن.
ثانيا: اختلاف هذه الموضوعات في أثناء الفترة الزمنية التي نزل فيها، حيث إن المستشرقين مولعون بتقسيم الزمن الذي نزل فيه القرآن إلى فترات متعددة، وسيأتي لهذه القضية حديث خاص فيما بعد إن شاء الله.