لقد اتبعت في هذا البحث المنهج الاستقرائي التحليلي الاستنباطي، فبعد قراءة الفتاوى مرات عديدة، حاولت الوقوف على جزئياتها، والربط بينها، محاولة إرجاع تلك الفروع والمسائل إلى أصولها وقواعدها، لاستخلاص مميزات منهجه الفقهي و أهم خصائصه.
واعتمدت المنهج الوصفي والتاريخي الذي مكّنني من تتبع سيرة الشاطبي الذاتية والعلمية، وملامح الحياة السياسية والاجتماعية والفكرية في عصره، وكذا معرفة أهم الأسباب التي جعلت أهل الأندلس يقبلون على المذهب المالكي.
كما اعتمدت على المنهج الاستنباطي حيث حاولت من خلال الفتاوى استنباط أهم سمات منهج الشاطبي في معالجة الحوادث المستجدة في المجتمع الأندلسي، واستنادا على هذا المنهج - أيضا - بذلت جهدي لمعرفة أبرز خصائص الفتوى في المدرسة الأندلسية.
أمّا الجانب الشكلي لهذا البحث فقد كان كالآتي:
-اعتمدت في توثيق الآيات القرآنية على رواية حفص.
-خرّجت الأحاديث من مصادرها بالرجوع إلى كتب السنة، بذكر الكتاب والباب ورقم الحديث الذي رمزت له بالحرف (ح) - إن وجد هذا الأخير-، وما اعتمدت في تخريجه على جهاز الحاسوب اكتفيت فيه بذكر من أخرجه مع ذكر الجزء والصفحة ورقم الحديث فقط.
-ذكرت معلومات النشر للمصادر والمراجع في بداية ورودها ثم بعدها اكتفيت بذكر اسم المؤلف وعنوان الكتاب، أو عنوان الكتاب فقط إن كثر استعماله أو اشتهرت معرفته.
-هناك عدة مصادر ومراجع رجعت فيها إلى أكثر من طبعة نظرا لتنقلي في البحث بين الجزائر وليبيا، فالموافقات - مثلا - اعتمدت فيها على نسختين. وفي حال رجوعي إلى نسخة دار الكتب العلمية اقتصرت على ذكر الجزء والصفحة، وأما إذا رجعت إلى النسخة الأخرى وهي نسخة دار المعرفة، فقد ذكرت دار النشر بين قوسين.
-ترجمت لمعظم الأعلام الواردة في البحث.