1.ديوان شعري: جمع ابنه عقيل توجد نسخة منه في مكتبة الاحقاف للمخطوطات بتريم وتحمل عنوان «الكلام المنظوم للحبيب العلامة عبد الله بن عمر بن يحيى» . (مخ: 2623) . [1]
2.أسئلة حول من يذكرون الله قياماً وقعوداً وبأنغام الموسيقى: تقع في ست وأربعين ورقة (مخ: 2821) .
3.السيف البتار فيمن يوالي الكفار ويجلب الحوائج إليهم: رسالة تقع في ثلاث أوراق.
4.خبر أهل الكساء: يقع في ثلاث أوراق.
5.تذكرة إخواننا الحجاج بسكان سربايا: تقع في ثلاث أوراق (مخ: 2821) .
(1) رمزت لمخطوطات مكتبة الأحقاف للمخطوطات بتريم في هذه الدراسة بالرمز (مخ) .