4 -بغية السائل في أمهات المسائل (في أصول الدين) .

5 -بغية الواصل في معرفة الفواصل.

6 -تفسير سورة (ق) وسورة (النبأ) .

7 «مختصر المعالين» وهو جزءان يتحدث فيه عن سورة الفاتحة التي تتضمن جميع القرآن.

8 -الرحيق السلسل في الأدب المسلسل.

9 -الرياض النواضر في الأشباه والنظائر.

10 -تحفة أهل الأدب في معرفة لسان العرب.

11 -شرح مقامات الحريري في مجلدين.

12 -موائد الحيس في شعر امرئ القيس.

13 -الشعار المختار على مختار الأشعار.

14 -الرسالة العلوية في القواعد العربية.

15 -إزالة الإنكار في مسألة كاد.

16 -الصعقة الغضبية في الرد على منكري العربية.

17 -الذريعة إلى معرفة أسرار الشريعة.

18 -الإشارات الالهية والمباحث الأصولية.

19 -مختصر الجامع الصحيح للترمذي.

والطوفي صاحب قريحة وقّادة، وذهن نفّاذ، وقدرة على الجدل والحوار، نستشف ذلك خلال كثير من الموضوعات في كتابه «الإكسير» كما نلمحه من بعض عناوين مصنفاته كجدل القرآن، والانتصارات الإسلامية في دفع شبه النصرانية، وتعاليق على الأناجيل وتناقضها، وتعاليق على الرد على جماعة من النصارى، ودرء القول القبيح في التحسين والتقبيح.

وكتاب الطوفي الذي نضعه بين يدي القارئ «الإكسير في علم التفسير» هو من نسخة فريدة مودعة بمكتبة قرة جلبي زاده بتركيا، وقد نسخ في القرن السابع الهجري في حياة المؤلف، وقام معهد إحياء المخطوطات العربية بتصويره، وعدد أوراقه 150 ورقة من القطع المتوسط.