وكان مسلم أَيضًا يناضل عن البخاري حتى أوحش ما بينه وبين محمد بن يَحيَى الذهلي بسببه فأخبرني محمد بن علي المقرئ، قال: أَخبَرنا محمد بن عَبد الله النيسابوري، قال: سَمِعْتُ أبا عَبد الله محمد بن يعقوب الحافظ يقول لما استوطن محمد بن إسماعيل البخاري نيسابور أكثر مسلم بن الحجاج الاختلاف إليه فلما وقع بين محمد بن يَحيَى والبخاري ما وقع في مسألة اللفظ ونادى عليه ومنع الناس من الاختلاف إليه حتى هجر وخرج من نيسابور في تلك المحنة قطعه أكثر الناس غير مسلم فإنه لم يتخلف عن زيارته فأنهي إلى محمد بن يَحيَى أن مسلم بن الحجاج على مذهبه قديما وحديثا وأنه عوتب على ذلك بالعراق والحجاز ولم يرجع عنه