ولدت فاطمة لعلي رضي الله عنهما:"حسنا"و"حسينا"و"محسنا"مات صغيرا، وولدت أيضا:"أم كلثوم"و"زينب".
ومرضت فاطمة رضي الله عنها أياما وتوفيت.
قال ابن سعد: أخبرنا عبد الله بن نمير، حدثنا إسماعيل، عن عامر قال: جاء أبو بكر رضي الله عنه إلى فاطمة رضي الله عنها حين مرضت، فاستأذن، فقال علي رضي الله عنه: هذا"أبو بكر"على الباب، فإن شئت أن تأذني له. فقالت: وذلك أحب إليك؟ قال: نعم. فدخل عليها واعتذر لها وكلمها، فرضيت عنه.
وتابعه أبو حمزة محمد بن ميمون السكري، فرواه عن إسماعيل بن أبي خالد، عن الشعبي قال: لما مرضت"فاطمة"عليها السلام أتاها"أبو بكر"رضي الله عنه فاستأذن، فقال علي رضي الله عنه: هذا"أبو بكر"يستأذن عليك. فقالت: أتحب أن آذن له؟ قال: نعم. فأذنت له، فدخل عليها يترضاها وقال: والله ما تركت الدار والمال والأهل والعشيرة إلا ابتغاء مرضات الله ورسوله ومرضاتكم أهل البيت. ثم ترضاها حتى رضيت.