في الكنيسة البروتستانتية، ملكوا قيادة الشعب على هذا النحو، وأنهم عندما استساغوا طعم الحكم وتلذذوا بحلاوته، بدءوا يفكرون في شكل ديموقراطي ... لقد شوهوا سمعتي وافتروا عليَّ في مواعظهم، لا لأية رذيلة في شخصي، بل لأني ملك اعتبروه أكبر رذيلة (6) ". وبذلك استؤنف نزاع العصور بين الكنيسة والدولة."
واتخذ النزاع آنذاك شكل هجوم أو حملة من القساوسة على الأساقفة. وكان هؤلاء-وهذا تراث كاثوليكي للكنيسة الاسكتلندية البروتستانتية-يختارون شكلًا بواسطة القساوسة ولكن كانوا فعلًا يعينون، وغالبًا ما يفرضون على الأكليروس بواسطة الوصي أو الملك. وكانوا يسلمون قدرًا كبيرًا من إيرادات الكنيسة في الحكومة. ولم يجد القساوسة في الكتب المقدسة سندًا أو أساسًا للنظام الأسقفي، ومن ثم عقدوا العزم على التخلص منه في إسكتلندة، على أنه لا يلتئم مع التنظيم الشعبي السائد في الكنيسة الاسكتلندية الوطنية الجديدة.
وكان زعيمهم أندرو ملفيل، اسكتلنديًا عنيفًا متحمسًا هيأته الطبيعة ليرث عباءة جون نوكس. وبعد أن أنهى تعليمه الجامعي في سانت أندروز، تابع دراسته في باريس، ورضع لبان مذهب كلفن على يد بيز B (ze في جنيف. ولدى عودته إلى إسكتلندة(1574) عين، وهو في التاسعة والعشرين من العمر، رئيسًا لجامعة جلاسجو، فأظهر مقدرة وكفاية في إعادة تنظيم المناهج. وقواعد الضبط والسلوك فيها. وفي 1578 أسهم في جمع"الكتاب الثاني لقواعد الانضباط والسلوك"الذي ندد بالنظام الأسقفي باسم المساواة الكهنوتية. ودافع عن الفصل النهائي بين مجالات كل من الكنيسة والدولة. وكان لهذا أثره في الفصل بينهما في الولايات المتحدة، ولكنه طالب بحق القساوسة في تدريب الحكام المدنيين على ممارسة سلطاتهم"على أساس كلمة الله (7) ". على أن جيمس، على أية حال، أراد أن يكون حاكمًا مطلقًا مثل هنري الثامن وإليزابث، وآمن بأن نظام الأساقفة ضروري للإدارة الكنسية، كما أنهم وسطاء مريحون بين الكنيسة والدولة.