على استقلال الهند سنة (1366 هـ) (1947 م) واعترفت بدولة باكستان في نفس العام.
ويعتقد أن جناح كان عميلا لبريطانيا. وهو من أصل إسماعيلي باطني، وما لبثت زوجته وأسرته أن تنصرت وقد أقام الباكستان على أصول إنكليزية دستوريا وسياسيا.
انضمت باكستان إلى هيئة الأمم المتحدة في منتصف شوال سنة (1366 هـ) وكان محمد علي جناح أول رئيس لها. وبعد وفاته سنة (1367 هـ) خلفه (الخوجا) نظام الدين الذي أعلن تطبيق الشريعة الإسلامية، ولكن ذلك لم يطبق.
وفي سنة (1376 هـ) وضع أول دستور لباكستان على أسس التشريعات الإنكليزية المتناقضة جملة وتفصيلا مع الشريعة الإسلامية. وبمقتضاه أصبحت (جمهورية دستورية) ، وكانت عاصمتها مدينة (كراتشي) ، وتولى (إسكندر ميرزا) رئاسة الجمهورية ثم تنازل عنها للقائد العسكري (محمد أيوب خان) .
وفي سنة (1385 هـ) وقعت الحرب بين الهند وباكستان حول إقليم كشمير ذي الغالبية المسلمة. وهزمت الأخيرة فتنازل أيوب خان عن رئاسة الجمهورية لقائد الجيش (الجنرال يحي خان) سنة (1389 هـ) .