توفي أبو منصور ابن السمرقندي يوم الخميس الثاني والعشرين من شوال سنة خمس وستين وخمس مئة، ودفن بمقبرة الشونيزي، رحمه الله وإيانا.
وأبو المظفر هذا تولى ديوان الزمام المعمور في أيام الإمام المقتفي لأمر الله -قدس الله روحه- في سنة أربع وأربعين وخمس مئة. فلما توفي وبويع لولده الإمام المستنجد -رضي الله عنه- أقره على ولايته إلى أن عزله في شهر ربيع الأول سنة ثمان وخمسين وخمس مئة.
وتوفي أبو المظفر في ليلة الأربعاء غرة ذي الحجة من سنة إحدى وستين وخمس مئة، ودفن في سحرتها بتربةٍ لهم بالحربية.