تنازع السعوديون مع آل خليفة على حكم قطر ، واشتبكوا معهم في قتال عنيف انتهى لصالح السعوديين الذي أصبحوا يحكمون قطر. و كان أول المبايعين محمد بن ثاني الذي تولى زعامة قبيلته؛ ومنذ ذلك الحين ظهر آل ثاني في قطر. و حاول الشيخ محمد بعد ذلك الانفصال عن حكم آل خليفة والانفراد بالحكم فجرت معارك بين الطرفين. انتهت عام (1299هـ/1882م) .
على أن محاولة الشيخ محمد أثمرت في عهد ابنه قاسم الذي اعتبر مؤسس إمارة آل ثاني المستقلة تحت سيادة الخلافة العثمانية في قطر؛ إذ إنه وحد قطر واستقل عن البحرين.
ثم تولى بعده ابنه الشيخ عبد الله من (1331هـ/1913م) إلى (1368هـ/1949م) .
و في عهد الشيخ عبد الله فقدت قطر سيادتها واستقلالها وأصبحت تحت الحماية البريطانية. كجاراتها. وعقدت معاهدة حماية سنة (1334هـ 1916م) وفي فترة حكمه تم اكتشاف البترول في قطر. ثم توفي الشيخ عبد الله ، وخلفه ابنه الشيخ علي من (1368هـ/1949م) إلى 1379هـ/1960م) و انسحبت بعد ذلك بريطانيا من الخليج لتعلن قطر استقلالها عام (1390هـ/1971م) . حيث دخلت كليا في النفوذ الأمريكي كما حصل لجيرانها.
وفي سنة (1391هـ/1972م) قام الشيخ خليفة بن حمد آل ثاني بالاستيلاء على السلطة في البلاد ،. وأعطتها بريطانيا الاستقلال عن الحماية البريطانية. وتحسنت أحولها الإقتصادية والاجتماعية مستفيدة من ثروة النفط الذي بدأ إنتاجه وتصديره منذ عام (1949م) .
ثم ظهر الغاز في قطر وصارت من أولى الدول المصدرة له في العالم. ثم عزل أمير قطر الحالي أباه أواخر التسعينيات وتولى السلطة ، وبدأت قطر في عهده تحاول لعب دور إقليمي في المنطقة ، وتناوئ السياسات السعودية. وتشهد تحولات سياسية تطويرية جريئة مقارنة بنظم الحكم الشمولية في الخليج العربي. وكان من أنجح سياساتها تلك ، إنشاء قناة الجزيرة الفضائية الجريئة المشهورة ذائعة الصيت.