وهي الجماعات التي قامت على أسس تربوية ومنهجية علمية أو مذهبية أو طرقية وتكون لها كيان تنظيمي وارتبط أعضائها ببيعة إلى رئيسهم أو شيخهم أو قائدهم .. ثم حملت السلاح للجهاد ضد الأعداء الخارجيين غالبا، أو في مسائل داخلية أحيانا.
كما تنقسم الجماعات الجهادية غير المنهجية إلى قسمين:
1.جماعات مجاهدة منظمة:
وهي الجماعات التي يرتبط أفرادها ببيعة وأمير وقيادة. وتقوم لها هياكل إدارية تنظيمية. و يربط أفرادها القضية الجهادية التي اجتمعوا عليها، كدفع الصائل أو إزالة أي منكر من المنكرات، أو التصدي لأي شكل من أشكال أعداء الإسلام والمسلمين. ولكن من دون أن يكون لهم منهج فكري محدد للاعتقاد والتربية ..
2.كتل وأفراد وتجمعات مجاهدة غير منظمة:
وهي محاولات الأفراد أو الكتل الصغيرة والشراذم المجاهدة التي قام أعضاؤها هنا وهناك بأعمال جهادية مشروعة، ولكن دون أن يكون لواحدهم أو مجموعهم فكر محدد ولا منهج اعتقاد وتربية، أو رابط يربط بين أعضائهم.
وهذا الفصل الذي نحن بصدده يركز على دراسة بعض ملامح وتجارب التيار الجهادي المسلح بشكل محدد. وهو أبرز وأهم مكونات الظاهرة الجهادية المسلحة. وأكثرها أثرا بل يشكل أساس الظاهرة، والجانب الأهم فيها من حيث الحجم والأثر ومستقبل المواجهة بيننا وبين أعدائنا والله أعلم.