تضمّنت الموسوعة التفسير المأثور، وهو تفسير النبي -صلى اللَّه عليه وسلم-، والصحابة، والتابعين، وتابعيهم إلى حدود عام 200 هـ (تقريبًا) .
وقد ضمّت الموسوعة قسمين رئيسين:
1 -آثار كتاب الدر المنثور في التفسير بالمأثور للسيوطي، وقد اعتمدت الموسوعة على طبعة دار هجر، وهي بإشراف الدكتور عبد اللَّه التركي.
2 -الزوائد على الدر المنثور.
* مراحل العمل الأساسية:
الأولى: مرحلة الجمع والمقابلة (تشمل جرد الكتب المسندة ومقابلة آثارها التفسيرية على الدر المنثور لاستخراج الزوائد إضافة إلى استخراج التوجيه والترجيح) .
الثانية: مرحلة التأليف والصياغة (تشمل تنقيح الدر المنثور وإضافة زوائده، ومن ثم تصنيفها وترتيبها والتأليف بينها، كذلك إضافة توجيه الآثار والترجيح بينها، وتخريج الأحاديث) .
الثالثة: مرحلة المراجعة والتدقيق.
الرابعة: مرحلة التنضيد والفهرسة والطباعة.