لجنة الخبراء تتشكل من رئيسها مدير المشروع, ومن الخبراء الأربعة بالمعلمة المتفرغين بالمشروع. وتتولى النظر في الخطوات العملية التنفيذية للمشروع, وتقويم البحوث المقدمة للمعلمة, والتقويم العام لأعمال الصياغة للقواعد, وفق المعايير والضوابط العلمية المعتمدة لديها. كما تنظر في طلبات وترشيحات توظيف الباحثين الجدد, وتقدم توصياتها بشأنها. وأعضاؤها هم:
-الأستاذ الدكتور جمال الدين عطية, مدير مشروع معلمة زايد للقواعد الفقهية والأصولية سابقا.
-الأستاذ الدكتور أحمد الريسوني, مدير مشروع معلمة زايد للقواعد الفقهية والأصولية.
-الأستاذ الدكتور محمد الروكي, رئيس لجنة القواعد الفقهية.
-الأستاذ الدكتور خليفة بابكر الحسن, رئيس لجنة القواعد الأصولية سابقا.
-الأستاذ الدكتور عبد الرحمن الكيلاني, رئيس لجنة القواعد الأصولية.
-الأستاذ الدكتور علي أحمد الندوي, رئيس لجنة الضوابط الفقهية.